Do zadań Wydziału Finansowego należy:

1. opracowywanie projektu budżetu w części "66 - Rzecznik Praw Pacjenta";
2. opracowywanie finansowej części budżetu zadaniowego i wieloletniego planu finansowego państwa z zakresu działania Rzecznika;
3. sporządzanie, w tym dla Sejmu Rzeczypospolitej Polskiej i Senatu Rzeczypospolitej Polskiej, materiałów, sprawozdań i informacji projektach i wykonaniu budżetu;
4. opracowywanie harmonogramu realizacji dochodów i wydatków;
5. opracowywanie wystąpień do Rady Ministrów oraz ministra właściwego do spraw finansów publicznych o uruchomienie środków budżetowych z rezerwy ogólnej i rezerw celowych;
6. wykonywanie zadań Urzędu jako jednostki budżetowej, dysponenta środków budżetowych trzeciego stopnia;
7. dokonywanie przeniesień pomiędzy paragrafami klasyfikacji budżetowej, w ramach zatwierdzonego dla Rzecznika na dany rok planu finansowego wydatków;
8. wykonywanie funkcji głównego księgowego urzędu i prowadzenie rachunkowości Urzędu;
9. prowadzenie kasy Urzędu;
10. sporządzanie sprawozdań i analiz finansowych z realizacji dochodów i wydatków budżetowych;
11. planowanie, realizacja i monitoring wydatków urzędu.